Análise Epigenética de Tumores Associados a Epilepsia de Longa Duração por Methylation-Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification

Autores

  • Joana Jesus-Ribeiro Neurology Department, Leiria Hospital Center, Leiria, Portugal; Coimbra Institute for Clinical and Biomedical Research (iCBR) and Center of Investigation on Environment, Genetics, and Oncobiology (CIMAGO), Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0002-0197-6780
  • Ilda Patrícia Ribeiro Coimbra Institute for Clinical and Biomedical Research (iCBR) and Center of Investigation on Environment, Genetics, and Oncobiology (CIMAGO), Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal; Laboratory of Cytogenetics and Genomics, Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0002-6096-8705
  • Luis Miguel Pires Coimbra Institute for Clinical and Biomedical Research (iCBR) and Center of Investigation on Environment, Genetics, and Oncobiology (CIMAGO), Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal; Laboratory of Cytogenetics and Genomics, Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0003-0847-721X
  • Olinda Rebelo Neuropathology Laboratory, Neurology Department, Coimbra University Hospital Center, Coimbra, Portugal
  • Ricardo Pereira Neurosurgery Department, Coimbra University Hospital Center, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0002-6895-1318
  • Conceição Bento Epilepsy and Sleep Monitoring Unit, Neurology Department, Coimbra University Hospital Center, Coimbra, Portugal
  • Francisco Sales Epilepsy and Sleep Monitoring Unit, Neurology Department, Coimbra University Hospital Center, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0003-0834-066X
  • Isabel Santana Neurology Department, Coimbra University Hospital Center, Coimbra, Portugal; Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0002-8114-9434
  • António Freire Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal; Neurology Department, Luz Hospital, Coimbra, Portugal https://orcid.org/0000-0003-4995-6655
  • Joana Barbosa Melo Coimbra Institute for Clinical and Biomedical Research (iCBR) and Center of Investigation on Environment, Genetics, and Oncobiology (CIMAGO), Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal; Laboratory of Cytogenetics and Genomics, Faculty of Medicine, University of Coimbra, Coimbra, Portugal

DOI:

https://doi.org/10.46531/sinapse/AO/220054/2023

Palavras-chave:

Epilepsia, Metilação de DNA, Neoplasias Encefálicas/ diagnóstico, Neoplasias Encefálicas/ genética, Perfilação da Expressão Génica

Resumo

Introdução: O ganglioglioma e o tumor neuroepitelial disembrioplásico representam as neoplasias mais comuns no grupo de tumores associados a epilepsia de longa duração. O mapeamento de alterações epigenéticas, particularmente a metilação do DNA, demonstrou oferecer perspetivas promissoras nos tumores cerebrais, identificando genes-chave que podem representar potenciais biomarcadores diagnósticos. O nosso objetivo é realizar uma análise genética e epigenética usando tecido de tumores associados a epilepsia de longa duração, para contribuir na identificação de tais biomarcadores.
Métodos: Alterações no número de cópias de DNA e padrão de metilação em genes relevantes para tumorigénese foram analisados por methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification, usando tecido pós-operatório fresco congelado obtido na cirurgia de epilepsia.
Resultados: Dos seis tumores incluídos no estudo (três gangliogliomas e três tumores neuroepiteliais disembrioplásicos), um ganglioglioma com mutação BRAF:p. V600E apresentou alterações na metilação. Este doente em particular tinha uma epilepsia focal, com o vídeo-eletroencefalograma (EEG) a revelar um padrão ictal na região occipito-parietal direita. A ressonância magnética cerebral revelou uma lesão temporal mesial direita. A frequência das crises aumentou apesar do tratamento antiepilético e dois anos depois foi submetido à sua primeira cirurgia. Mais duas cirurgias foram realizadas anos depois devido à recorrência de crises associada ao aumento do tumor residual. A classe de Engel pós-cirurgia é IIA aos três anos de seguimento. Perdas no número de cópias foram detetadas nos cromossomas 1p (TP73), 2p (MSH6), 3p (VHL), 10p (CREM), 11q (GSTP1), 12q (CHFR), 14q (MLH3), 16p (PYCARD), 17p (TP53), 17q (BRCA1) and 19p (STK11). Ganhos no número de cópias foram detetados no cromossoma 11p (CD44). Os genes MGMT (58%) e CD44 (51%) encontravam-se metilados.
Conclusão: Identificou-se um elevado número de alterações cromossómicas num ganglioglioma, com predomínio de deleções, reforçando o espectro de alterações cromossómicas previamente descrito. Observámos um ganho no número de cópias e metilação do CD44, que contribui para interações célula-célula/célula-matriz. A metilação do MGMT, envolvida na reparação do DNA, está de acordo com outros estudos. Os nossos dados destacam a importância de desvendar novos desequilíbrios cromossómicos e o papel da metilação do DNA nesses tumores, fornecendo mais argumentos a favor de uma classificação histológica e (epi)genética integrada.

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Publicado

2024-04-20

Como Citar

1.
Jesus-Ribeiro J, Ribeiro IP, Pires LM, Rebelo O, Pereira R, Bento C, et al. Análise Epigenética de Tumores Associados a Epilepsia de Longa Duração por Methylation-Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification. Sinapse [Internet]. 20 de Abril de 2024 [citado 15 de Julho de 2024];22(4):160-8. Disponível em: https://sinapse.pt/index.php/journal/article/view/50

Edição

Vol. 22 N.º 4 (2022): Outubro - Dezembro

Secção

Artigos Originais

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Direitos de Autor (c) 2024 Joana Jesus-Ribeiro, Ilda Patrícia Ribeiro, Luis Miguel Pires, Olinda Rebelo, Ricardo Pereira, Conceição Bento, Francisco Sales, Isabel Santana, António Freire, Joana Barbosa Melo

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